Революционизация геномики в сельском хозяйстве с помощью целевой секвенирования и секвенирования всего генома с низким покрытием

Вступление:

В сегодняшнем постоянно меняющемся мире сельское хозяйство сталкивается с многочисленными проблемами. С ростом мирового населения и увеличением экологических проблем потребность в инновационных решениях в сельском хозяйстве никогда не была такой великой. Геномика, изучение полного набора генов организма, выдвинулась в качестве мощного инструмента для революционизации сельского хозяйства. В этом блоге мы рассмотрим две революционные технологии генотипирования - целевое секвенирование и секвенирование всего генома с низким покрытием - и их роль в улучшении программ селекции. Мы также обсудим секвенаторы MGI, которые рекомендуются для этих техник, и их потенциал для развития геномных исследований в сельском хозяйстве.

Сила геномики в сельском хозяйстве:

Геномика трансформирует сельское хозяйство, предоставляя уникальные взгляды на генетический состав организма. Она позволяет ученым и селекционерам принимать обоснованные решения, ускорять программы селекции и разрабатывать более совершенные сельскохозяйственные культуры и скот. Вот несколько ключевых способов, которыми геномика изменяет сельское хозяйство:

1. Улучшенные программы селекции:

   • Геномные данные помогают определять желательные характеристики и выбирать перспективных кандидатов для селекции.

   • Маркёры ДНК, связанные с конкретными признаками, предоставляют ценные сведения, помогая селекционерам принимать обоснованные решения.

2. Устойчивость к болезням:

   • Геномный анализ определяет гены, связанные с устойчивостью к болезням, что приводит к выращиванию сельскохозяйственных культур и скота с повышенной иммунитетом.

   • Снижение зависимости от пестицидов и химикатов способствует экологически чистым методам ведения сельского хозяйства.

3. Оптимизация использования ресурсов:

   • Геномика поддерживает разработку сельскохозяйственных культур, требующих меньше ресурсов, таких как вода и удобрения, при сохранении высоких урожаев.

   • Точное сельское хозяйство, основанное на геномике, настраивает методы ведения хозяйства под конкретные потребности культур, снижая потери.

4. Дикие родственные сельскохозяйственные культуры (ДРСК):

   • Геномика исследует генетическое разнообразие ДРСК, открывая ценные характеристики для улучшения сортов культур.

5. Улучшение разнообразия сельскохозяйственных культур:

   • Геномика полезна не только для крупных культур, но и для мелких и регионально важных культур, способствуя продовольственной безопасности региона.

Целевое секвенирование: точное генотипирование для сельского хозяйства:

Целевое секвенирование - технология генотипирования, обеспечивающая эффективное и доступное решение для генотипирования больших популяций в сельском хозяйстве. Вот почему оно завоевывает популярность:

1. Точность и экономичность:

   • Целевое секвенирование фокусируется на конкретных геномных областях интереса, позволяя точно обнаруживать соответствующие генетические варианты.

   • Эта технология предлагает доступность, что делает ее осуществимой для селекционеров для генотипирования больших выборок.

2. Гибкость в дизайне панели:

   • Селекционеры могут настраивать секвенировочные панели, включая области генома, связанные с их целевыми характеристиками.

   • Панели могут легко адаптироваться по мере изменения приоритетов селекции.

3. Комплексное покрытие генома:

   • При фокусировке на конкретных областях целевого секвенирования панели могут охватывать значительную часть генома.

   • Это позволяет идентифицировать многочисленные генетические варианты, улучшая программы селекции.

Секвенирование всего генома с низким покрытием: разблокирование всего генома:

Секвенирование всего генома с низким покрытием - еще одна революционная технология, объединяющая доступность и комплексное покрытие генома. Вот почему она приобретает популярность в сельском хозяйстве:

1. Доступность и масштабируемость:

   • Секвенирование всего генома с низким покрытием значительно снижает стоимость на один образец, что делает его подходящим для крупных программ селекции.

   • Селекционеры могут секвенировать значительное количество особей, не нарушая бюджет.

2. Комплексное исследование генома:

   • В отличие от целевых подходов секвенирование всего генома с низким покрытием охватывает весь геном.

   • Это позволяет селекционерам исследовать генетические варианты по всему геному, предоставляя сведения о различных характеристиках.

3. Идентификация новых характеристик:

   • Секвенируя весь геном, селекционеры могут идентифицировать новые генетические варианты, связанные с желательными признаками.

   • Эта технология имеет потенциал разблокировать ранее неоткрытые генетические ресурсы.

Секвенаторы MGI: усиление геномических исследований в сельском хозяйстве

Для осуществления потенциала геномики в сельском хозяйстве исследователям и селекционерам требуются передовые технологии секвенирования ДНК. Секвенаторы MGI выступают важными инструментами в геномных исследованиях в сельском хозяйстве, предлагая мощные решения для генотипирования. Вот почему секвенаторы MGI находятся на передовой в геномных исследованиях в сельском хозяйстве:

1. Экономичное секвенирование:

   • Секвенаторы MGI стали более доступными, делая геномные исследования более экономичными.

   • Эта доступность позволяет исследователям секвенировать большее количество образцов, облегчая комплексные генетические исследования в сельском хозяйстве.

2. Секвенирование длинных избирательных участков:

   • Секвенаторы MGI предлагают как короткие, так и длинные варианты секвенирования, обеспечивая гибкость для различных исследовательских потребностей.

   • Длинное секвенирование ценно особенно для сборки сложных геномов с точностью и полнотой.

3. Сборки генома на уровне хромосом:

   • Секвенаторы MGI, совместно с передовым сборочным программным обеспечением, позволяют осуществлять сборки геномов на уровне хромосом.

   • Полные геномы предоставляют детальное понимание генетического состава организма, помогая в идентификации ценных характеристик.

4. Высококачественные геномные данные:

   • Секвенаторы MGI предоставляют геномные данные высокого качества, гарантируя надежность геномных анализов.

   • Исследователи могут уверенно использовать эти данные для задач, таких как генетическое предсказание, маркерная отбор и идентификация интересующих генов.