Home

Профилирование иммунного репертуара с использованием DNBSEQ

26 окт. 2023 г.
Share article

Speakers,

:

Д-р Шон Хуан

,

Доктор Ян Хэн

,

Др. Сяодзин Хуо

,

Доктор Джон Бекфорд

,

Др. Шавета Гойял


Профилирование иммунного репертуара с использованием DNBSEQ
Профилирование иммунного репертуара с использованием DNBSEQ
Профилирование иммунного репертуара с использованием DNBSEQ

Профилирование иммунного репертуара с помощью DNBSEQ

В мире геномики и биомедицинских исследований способность точно секвенировать и проанализировать генетический материал имеет первостепенное значение. Исследователи полагаются на передовые технологии секвенирования для разгадывания секретов ДНК и РНК, открывая путь для революционных открытий в областях, таких как исследования заболеваний, онкология и многое другое. В этом блог-посте мы погрузимся в трансформационные возможности секвенаторов MGI, в частности DNBSEQ-G99, T7 и G400, как это было подчеркнуто на недавнем вебинаре по теме "Профилирование иммунного репертуара с помощью DNBSEQ".

Секвенаторы MGI: Поддержка геномных исследований

Прежде чем мы углубимся в детали вебинара, давайте на мгновение постараемся понять значимость секвенаторов MGI в области геномики. MGI, дочерняя компания BGI Group, известна своими передовыми технологиями секвенирования, которые сыграли важную роль в продвижении геномных исследований по всему миру. Их секвенаторы известны своей точностью, масштабируемостью и экономичностью, что делает их идеальным выбором для широкого спектра применений.

В области профилирования иммунного репертуара и не только секвенаторы MGI доказали свою бесценность, предоставляя исследователям возможность генерировать данные высокого качества и получать глубокие познания в сложные биологические системы. Теперь давайте изучим основные моменты вебинара и роль секвенаторов MGI в представленных исследованиях.

Профилирование иммунного репертуара: Окно в исследования заболеваний

Вебинар с названием "Профилирование иммунного репертуара с помощью DNBSEQ" знакомит нас с миром секвенирования рецепторов Т-клеток (TCR) и B-клеток (BCR). Профилирование иммунного репертуара, фундаментальный аспект иммуногенетики, играет ключевую роль в понимании реакции иммунной системы на заболевания и патогены. Важность секвенирования и анализа TCR и BCR с высокой точностью трудно переоценить при раскрытии сложностей иммунных реакций.

Основное внимание вебинара уделяется инновационной методологии захвата, секвенирования и анализа иммунных репертуаров, проливая свет на мощные возможности секвенаторов MGI, в частности DNBSEQ-G99, T7 и G400. Давайте изучим основные выводы с вебинара:

Технология DNBSEQ: Игровое преимущество

Вебинар знакомит нас с технологией DNBSEQ, которая лежит в основе секвенаторов MGI. DNBSEQ, или Секвенирование ДНК-наношариками, является революционным подходом, предлагающим ряд преимуществ:

  1. Точное иммунное профилирование: Технология DNBSEQ обеспечивает точное иммунное профилирование, критически важное для исследований заболеваний и онкологии. Она позволяет исследователям захватывать и секвенировать TCR и BCR с непревзойденной точностью.

  2. Большое поле зрения: Одной из выдающихся особенностей технологии DNBSEQ является ее способность предоставлять обширное поле зрения. С большими микросхемами DNB размером до 13х13 см исследователи могут анализировать обширные тканевые срезы, потенциально охватывающие половину человеческого мозга.

  3. Высокое пространственное разрешение: Технология DNBSEQ гордится исключительным пространственным разрешением. С расстоянием между центрами пятен около 500 нанометров исследователи могут достичь субклеточного разрешения, гарантирующего, что данные об экспрессии генов не смешиваются с соседними пятнами.

  4. Широкий спектр применений: Гибкость технологии DNBSEQ очевидна из ее применимости к различным видам, включая мышиные эмбрионы, агиентов, человеческие ткани, клетки Mala и др. Эта универсальность привела к публикациям в престижных журналах, таких как Cell, Nature и Science (S).

Мультиомные исследования с Stereo-Seq: РНК и белок вместе

Хотя экспрессия генов и транскриптомика предоставляют ценные сведения, они представляют лишь один уровень информации. Для полного понимания клеточной идентичности и функций исследователям необходимо объединить различные модальности, включая геномную, эпигеномную и протеомную информацию.

Сила мультиомной интеграции

Вебинар подчеркивает важность интеграции нескольких модальностей данных. Объединяя геномную и протеомную информацию, исследователи могут точно фенотипировать клеточные идентичности, раскрывать биологические истины и решать сложные вопросы в исследованиях заболеваний.

DNBSEQ-G99
DNBSEQ-G99
DNBSEQ-G99

DNBSEQ-G99

Развитие геномных знаний в иммунном профилировании

DNBSEQ-G99 от MGI выделяется в профилировании иммунного репертуара, обеспечивая непревзойденную точность и эффективность. Его секвенирование является ключевым для точного анализа рецепторов T-клеток и B-клеток, повышая наше понимание роли иммунной системы в заболеваниях и потенциальных терапевтических путях.

Исследовать продукт

Стерео-Seq: Одновременное обнаружение РНК и белков

Метод Стерео-Seq, представленный в MGI, вводится как прорывной подход к одновременному обнаружению экспрессии генов (РНК) и экспрессии белков на одном срезе ткани. Вот как это работает:

  1. Высокоплексные панели антител: Стерео-Seq использует высокоплексные панели антител, такие как 268 антител от B legend, для захвата экспрессии белков. Эти антитела разработаны с определенными особенностями, включая адаптеры для ПЦР-усиления и 15-нуклеотидные штрихкоды для идентификации антител.

  2. Поли-А хвосты и ДНК-штрихкоды: Технология использует поли-А хвосты на антителах вместе с ДНК-штрихкодами на DNB-чипах для захвата как РНК, так и антитело-производные молекулы одновременно.

  3. Конструирование библиотеки и секвенирование: После захвата процесс продолжается конструированием библиотеки и секвенированием, что приводит к генерации профилей как РНК, так и белков из одного и того же среза ткани.

  4. Раскрытие клеточной сложности: Сила Стерео-Seq заключается в его способности раскрывать сложные детали клеточной сложности. Путем изучения пространственного распределения экспрессии генов и экспрессии белков исследователи могут дифференцировать подтипы клеток и получать более глубокие понимание биологических процессов.

Согласованность данных и точность

Способность Стерео-Seq обеспечивать согласованные и точные данные является критическим фактором для его полезности для исследователей. Вебинар представляет убедительные доказательства воспроизводимости и надежности данных:

  1. Согласованность между срезами: Исследователи провели эксперименты с использованием трех последовательных срезов ткани, применяя Стерео-Seq к каждому из них. Полученные данные об экспрессии генов и белков проявили высокую согласованность и корреляцию, демонстрируя воспроизводимость метода.

  2. Корреляция между РНК и белками: Для оценки точности исследователи сравнили образцы экспрессии белков, полученные через Стерео-Seq, с образцами иммуногистохимической флуоресценции. Наблюдаемая сильная корреляция указывает на точность метода в отражении истинной биологии тканей.

  3. Плексивность и качество данных: Способность Стерео-Seq обрабатывать разные уровни плексивности (т.е. количество используемых антител) была протестирована. Результаты показали, что увеличение плексивности не отрицательно сказывается на обнаружении как РНК, так и белков, подчеркивая надежность метода.

Разблокирование понимания различных типов тканей

Вебинар подчеркивает универсальность Стерео-Seq, показывая его применение в различных типах тканей:

  1. Ткани мыши: Исследователи собрали данные из тканей мыши, раскрывая пространственное распределение иммунных клеток, макрофагов, эритроцитов и других. Подклеточное разрешение предоставило ценные понимание взаимодействий и структур клеток.

  2. Ткани человека: Применение Стерео-Seq распространилось на ткани человека, где были выделены различные подтипы клеток в одних и тех же срезах тканей. Пространственное распределение клеточных маркеров подчеркнуло потенциал технологии в понимании сложной биологии человека.

Стерео-Seq и интеграция данных ADT

Один из интригующих аспектов, обсуждаемый в вебинаре - это интеграция данных тегов, происходящих от антител (ADT). Исследователи сравнили данные ADT с данными РНК и получили интересные результаты:

  • ADT предлагает уникальные инсайты: Данные ADT, представляющие экспрессию белков, показали значительные различия по сравнению с данными транскриптомики. В некоторых случаях белки, которые едва обнаруживались в данных транскриптомики, четко наблюдались в данных об экспрессии белков.

  • Вклад белков в подтипизацию: Интеграция данных ADT существенно способствовала идентификации клеточных подтипов как в экспрессии генов, так и в пространственном контексте. Это подчеркивает важность включения информации о белках в анализ для получения более полного понимания клеточной биологии.

Будущие направления: Освоение мультиомной интеграции

По мере того, как исследователи продолжают изучать потенциал Стерео-Seq и мультиомной интеграции, открываются захватывающие перспективы для будущих исследований. Вот некоторые ключевые моменты интереса:

  • Деградация белков: Понимание механизмов деградации белков и их роли в заболеваниях, таких как болезнь Альцгеймера, может открыть новые возможности для терапевтических вмешательств. Способность Стерео-Seq захватывать экспрессию белков может сыграть ключевую роль в таких исследованиях.

  • Разногласия в данных о белках и РНК: Требуется дальнейшее исследование, чтобы разъяснить причины наблюдаемых разногласий между данными о белках и РНК. Исследование причин, по которым определенные гены показывают различные паттерны экспрессии, может принести ценные инсайты.

  • Подтипизация клеток: Использование интегрированных мультиомных данных для идентификации и классификации клеточных подтипов с точностью обладает большим потенциалом. Это может привести к прорывам в персонализированной медицине и целенаправленной терапии.

  • Поиск биомаркеров болезней: Комбинация данных РНК и белков предлагает мощную платформу для обнаружения биомаркеров болезней. Определение конкретных молекул, связанных с заболеваниями, может помочь в ранней диагностике и стратегиях лечения.

Заключение: Секвенаторы MGI трансформируют геномное исследование

В заключение, вебинар по теме "Профилирование иммунного репертуара с помощью DNBSEQ" демонстрирует удивительные возможности секвенаторов MGI, особенно DNBSEQ-G99, T7 и G400, в продвижении геномного исследования. Интеграция мультиомных данных через Стерео-Seq открывает новые возможности для понимания сложных биологических систем, механизмов болезней и клеточных взаимодействий.

Секвенаторы MGI стали незаменимыми инструментами для исследователей в их стремлении раскрыть тайны генома. Будь то изучение иммунных репертуаров, исследование болезней или персонализированная медицина, точность и универсальность секвенаторов MGI побуждают открытия, которые имеют потенциал изменить будущее здравоохранения.

Обладая способностью одновременно захватывать данные как РНК, так и белков, исследователи могут погружаться глубже в молекулярные тонкости клеток и тканей. Этот комплексный подход обещает ускорить прогресс в таких различных областях, как иммунология, онкология, нейронаука и далее.

По мере развития области геномики секвенаторы MGI стоят на переднем крае, позволяя исследователям выходить за пределы знаний и толкать инновации. Будущее геномного исследования светло, а секвенаторы MGI освещают путь.

Отказ от ответственности: Предоставленная информация в этом блоге предназначена исключительно для образовательных и информационных целей и не предназначена для использования в диагностических процедурах. Упомянутые продукты MGI предназначены исключительно для научных исследований.

DNBSEQ-T7
DNBSEQ-T7
DNBSEQ-T7

DNBSEQ-T7

Точность в профилировании иммунного репертуара

MGI's DNBSEQ-T7 - это важный инструмент для профилирования иммунного репертуара в геномике и биомедицинском исследовании. Благодаря своим возможностям высокопроизводительного секвенирования, T7 способен захватывать сложные генетические вариации, важные для понимания иммунных ответов и развития таких областей, как онкология и исследования заболеваний.

Исследовать продукт

Speakers

Доктор Шон Хуан - Директор, Лаборатории и Услуги - Точная Геномика @MiRXES
Доктор Шон Хуан - Директор, Лаборатории и Услуги - Точная Геномика @MiRXES
Доктор Шон Хуан - Директор, Лаборатории и Услуги - Точная Геномика @MiRXES

Д-р Шон Хуан

Директор, Лаборатория и Услуги

Visit Company site

Доктор Янг Хэн - Ученый @BGI Research
Доктор Янг Хэн - Ученый @BGI Research
Доктор Янг Хэн - Ученый @BGI Research

Доктор Ян Хэн

Ученый @BGI Research

Visit Company site

Д-р Сяодзин Хоу - старший менеджер по продукции @Singleron Biotechnologies
Д-р Сяодзин Хоу - старший менеджер по продукции @Singleron Biotechnologies
Д-р Сяодзин Хоу - старший менеджер по продукции @Singleron Biotechnologies

Др. Сяодзин Хуо

Старший менеджер по продукту @Singleron Biotechnologies

Visit Company site

Доктор Джон Бекфорд - ученый @Takara Bio
Доктор Джон Бекфорд - ученый @Takara Bio
Доктор Джон Бекфорд - ученый @Takara Bio

Доктор Джон Бекфорд

Учёный @Takara Bio

Visit Company site

Доктор Шавета Гойял - Научный сотрудник @Takara Bio
Доктор Шавета Гойял - Научный сотрудник @Takara Bio
Доктор Шавета Гойял - Научный сотрудник @Takara Bio

Др. Шавета Гойял

Научный сотрудник @Takara Bio

Visit Company site

Геномика

Технология секвенирования

Профилирование иммунного репертуара

Приборы секвенирования MGI

Интеграция мультиомной

Share article
Клиническое секвенирование экзомов до отчетности
Клиническое секвенирование экзомов до отчетности
Клиническое секвенирование экзомов до отчетности

Клиническое секвенирование экзомов до отчетности

22 мая 2023 г.


Исследуйте продвинутый мир геномики с помощью секвенаторов MGI в клиническом секвенировании экзома. Раскройте преимущества, процесс анализа и кейс-стади в этом подробном руководстве.

Читать

Пространственное улучшенное разрешение омикс-секвенирования Новые горизонты пространственной мультиомики
Пространственное улучшенное разрешение омикс-секвенирования Новые горизонты пространственной мультиомики
Пространственное улучшенное разрешение омикс-секвенирования Новые горизонты пространственной мультиомики

Революционизация сельского хозяйства: освоение потенциала геномики

20 июн. 2023 г.


Раскройте трансформационную роль геномных исследований в сельском хозяйстве. Исследуйте, как достижения, такие как секвенирование следующего поколения, переформатируют программы селекции, прокладывая путь к продовольственной безопасности и устойчивым практикам.

Читать

Приведение мощности выбора к последовательности
Приведение мощности выбора к последовательности
Приведение мощности выбора к последовательности

Революционирование Диагностика Всего Экзома Секвенирование с DNBSEQ

4 июл. 2023 г.


Технология DNBSEQ™, возглавляемая компанией MGI Tech, революционизировала геномное исследование, предлагая исключительную точность, высокую производительность и экономичность. Её основная технология, DNB NanoBalls, революционизирует процесс секвенирования, закрепляя фрагменты ДНК на крошечных наношариках, обеспечивая большую точность и воспроизводимость.

Читать

Пространственное улучшенное разрешение омикс-секвенирования Новые горизонты пространственной мультиомики
Пространственное улучшенное разрешение омикс-секвенирования Новые горизонты пространственной мультиомики
Пространственное улучшенное разрешение омикс-секвенирования Новые горизонты пространственной мультиомики

Пространственное улучшенное разрешение омикс-секвенирования Новые горизонты пространственной мультиомики

16 авг. 2023 г.


Раскройте трансформационное влияние пространственного улучшенного разрешения секвенирования омиксов в Genomics Unlocked. Погрузитесь в стерео-секвенирование и Human Protein Atlas, меняющие наше понимание человеческого мозга и патологии заболеваний.

Читать

Комплексный молекулярный анализ опухоли (КМАО) с интеграцией RNAseq и TME для целенаправленной терапии
Комплексный молекулярный анализ опухоли (КМАО) с интеграцией RNAseq и TME для целенаправленной терапии
Комплексный молекулярный анализ опухоли (КМАО) с интеграцией RNAseq и TME для целенаправленной терапии

Комплексный молекулярный анализ опухоли (КМАО), объединяющий RNAseq и TME для целенаправленной терапии

20 сент. 2023 г.


Точная онкология переопределяет лечение рака. CMTA, объединяя секвенирование РНК и анализ TME, прокладывает путь для персонализированного лечения, адаптированного под индивидуальные профили пациентов, давая возможность эффективного управления раком.

Читать

Закрытие разрыва в лечении рака с помощью силы точной онкологии
Закрытие разрыва в лечении рака с помощью силы точной онкологии
Закрытие разрыва в лечении рака с помощью силы точной онкологии

Закрытие разрыва в лечении рака с помощью силы точной онкологии

15 мар. 2024 г.


Рак, вызывающий одну шестую часть всех смертей в мире, превышает смертность от СПИДа, туберкулеза и малярии в совокупности. Прогресс в области геномики стимулирует развитие точной онкологии. Доктор Мари-Лор Яспо из ALACRIS Theranostics использует инструменты MGI для лучшего управления раком, начиная с профилактики и заканчивая терапией.

Читать

pagination here
Геномика Разблокирована Основные сведения

Присоединяйтесь к нашему информационному бюллетеню, чтобы быть в курсе наших последних вебинаров.

Геномика Разблокирована Основные сведения

Присоединяйтесь к нашему информационному бюллетеню, чтобы быть в курсе наших последних вебинаров.

Геномика Разблокирована Основные сведения

Присоединяйтесь к нашему информационному бюллетеню, чтобы быть в курсе наших последних вебинаров.